化学通报

北大核心,CA,JST,CSCD扩展版,WJCI

国内刊号:11-1804/O6

国际刊号:0441-3776

化学通报杂志2019年第7期:HIV-1整合酶链转移抑制剂的3D-QSAR、分子对接和分子动力学模拟研究

发布日期:

作者:刘冬琳,刘鹰翔,李耿,马玉卓,曾巧玲

关键词:INSTIs,三维定量构效关系,分子对接,分子动力学模拟,

为了获得高活性、结构新颖的INST抑制剂,本文采用CoMFA和CoMSIA两种方法对32个萘啶类INST抑制剂进行了三维定量构效关系的研究,并建立了相关模型,其交叉验证系数分别为q2=0.809和q2=0.816,拟合验证系数分别为r2=0.998和r2=0.981,表明所建立的模型是可靠的且具有一定的预测能力。利用分子对接探讨小分子化合物与INST蛋白的相互作用模式,结合模式表明,萘啶类化合物主要通过疏水作用和氢键作用与INSTIs蛋白结合。最后通过分子动力学模拟进一步验证对接结果,发现对接的结合模式与分子动力学模拟得到的结果是一致的。本研究获得的综合模型和推论可以为开发有效的HIV整合酶链转移抑制剂提供重要的理论基础。

来源:2019年第7期

《化学通报》期刊编辑部

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