化学通报

作者：史祥睿,代宇婕,张弢,张庆华,刘威

关键词：NDM-1,thanatin,分子对接,动力学模拟,活性,

基金：陆军军医大学临床技术创新培育项目(CX2019LC118)资助

耐碳青霉烯类抗生素的超级细菌给人类健康带来了严重威胁，其所携带的金属 β-内酰胺酶编码基因是耐药性的主要来源。NDM-1作为其中传播最广、活性最强的 β-内酰胺酶，其抑制剂的研发刻不容缓。具有广谱作用的抗菌肽thanatin对NDM-1展现出了较好的抑制效果，但抑制机理并不清楚。本文使用HPEPDOCK与Rosetta FlexPepDock服务器，将thanatin与NDM-1进行了分子对接，并使用Desmond软件包对对接模型进行了分子动力学模拟。结果表明，thanatin与NDM-1活性中心的Zn2+ 并无直接相互作用，而作为竞争性抑制剂结合于NDM-1的活性口袋，阻止抗生素分子进入活性口袋与Zn2+ 结合，从而抑制NDM-1的水解活性。本文为研发有效的NDM临床抑制剂探索了可行的方法。

来源：2021年第11期

《化学通报》期刊编辑部

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