化学通报

北大核心,CA,JST,CSCD扩展版,WJCI

国内刊号:11-1804/O6

国际刊号:0441-3776

化学通报杂志2021年第5期:DCN1-UBE2M相互作用抑制剂的3D-QSAR、分子对接和分子动力学研究

发布日期:

作者:曾巧玲,刘鹰翔,李耿,马玉卓

关键词:DCN1-UBE2M相互作用,哌啶基脲类化合物,3D-QSAR,分子对接,分子动力学模拟,

基金:国家自然科学基金项目(81803813)资助

类泛素化是一种蛋白质翻译后修饰,其异常会导致神经退行性疾病和多种肿瘤的发生,因此它被视为有希望的抗肿瘤靶标。研究表明,抑制DCN1-UBE2M相互作用可选择性阻遏类泛素化。本文基于哌啶基脲类DCN1-UBE2M相互作用抑制剂进行3D-QSAR、分子对接和分子动力学模拟研究。利用3D-QSAR中的CoMFA和CoMSIA方法构建了相关模型,其交叉验证系数q2分别为0.686、0.682,拟合验证系数r2分别为0.966、0.931,表明模型是可靠的且预测能力较好。接着运用分子对接分析哌啶基脲类化合物与DCN1的相互作用,结果表明,它们主要通过氢键和疏水作用与靶蛋白结合。通过分子动力学模拟研究进一步了解结合模型和验证对接结果。本文所得的研究结果可为今后此类化合物的结构优化提供有效信息。

来源:2021年第5期

《化学通报》期刊编辑部

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