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国内刊号:11-1804/O6
国际刊号:0441-3776
发布日期:
作者:杨艺璠,宋秀庆,高志明,未朝春,闫 红,钟启迪
关键词:ULK1抑制剂,药效团模型,分子对接,分子动力学模拟,
基金:河北省自然科学基金项目(C2020209081)资助
Unc-51样自噬激活激酶1(unc-51-like autophagy activating kinase 1,ULK1)作为自噬启动的重要调控因子,是肿瘤治疗的关键靶点之一。首先,以已知ULK1抑制剂为基础构建药效团模型,通过药效团模型筛选、分子对接以及分子力学广义波恩表面积(Molecular Mechanics/Generalized Born Surface Area,MM/GBSA)结合自由能计算等方法,对含有52万多个类药性小分子的数据库进行虚拟筛选,得到具有较高理论亲和力的化合物。随后,50ns的分子动力学模拟验证了蛋白质-配体复合物结合的稳定性,最后10ns的平均结合自由能的计算研究进一步验证了配体的结合能力。结果表明,6个化合物(F5258-0159、F3407-0428、F0529-1100、F0696-3531、F3222-5280、F6525-5596)具有骨架新颖、分子对接分数和结合自由能数值优异及与ULK1的结合状态稳定等特点,可以作为新型潜在的ULK1抑制剂用于肿瘤治疗的研究,也为新型ULK1抑制剂的设计和研发提供新的研究思路。
来源:2024年第1期
《化学通报》期刊编辑部
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