国内刊号:11-1804/O6
国际刊号:0441-3776
发布日期:
作者:冉稳坐,曹洪玉,唐乾,王立皓,郑学仿
关键词:异榭皮苷,DC-SIGN,分子对接,分子动力学模拟,拉伸分子动力学模拟,
基金:国家自然科学基金项目(21571025,21601024,21601025)、辽宁省教育厅基本科研项目(LJ212411258006)、大连大学学科建设专项(学科交叉项目)(DLUXK-2023-YB-007)和大连大学平台科研项目(202101ZD01)资助
DC-SIGN碳水化合物识别域与单糖结合产生生物活性,是抑制病毒反式感染细胞的潜在靶点。目前实验研究表明葡萄糖类化合物异榭皮苷,红景天苷,汉黄苓苷等可抑制SARS-CoV-2感染。本研究通过分子动力学模拟等方法理解含糖苷分子结合DC-SIGN碳水化合物识别域机理,确定抗病毒效果及机制。分子对接表明,红景天苷具有葡萄糖基结合DC-SIGN的经典构象。分子动力学模拟表明,异榭皮苷、红景天苷具有葡萄糖基结合DC-SIGN的相似构象,而汉黄苓苷、连翘苷与关键氨基酸形成氢键相互作用较少。异榭皮苷从DC-SIGN碳水化合物识别域拉伸到4 ?时拉力最大(1540.443 pN),红景天苷在3.9 ?时拉力最大(1640.999 pN),显示其更难分离。综上表明,异榭皮苷、红景天苷可能与DC-SIGN碳水化合物识别域结合,可能作为治疗这些病毒感染的候选药物。
来源:2025年第3期
《化学通报》期刊编辑部